Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L3BQ96GX2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms