Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCU5

GRIN3A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3AQ8TCU5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3AQ8TCU5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN3AQ8TCU5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms