Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms