Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LMOD2Q6P5Q4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
LMOD2Q6P5Q4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms