Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD20A3Q5VUR7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD20A3Q5VUR7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms