Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms