Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms