Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPNMBQ14956 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPNMBQ14956 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPNMBQ14956 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms