Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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