Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NID2Q14112 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NID2Q14112 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NID2Q14112 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NID2Q14112 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NID2Q14112 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NID2Q14112 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NID2Q14112 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NID2Q14112 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NID2Q14112 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NID2Q14112 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NID2Q14112 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NID2Q14112 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NID2Q14112 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NID2Q14112 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NID2Q14112 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NID2Q14112 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NID2Q14112 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NID2Q14112 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NID2Q14112 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NID2Q14112 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NID2Q14112 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NID2Q14112 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NID2Q14112 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NID2Q14112 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NID2Q14112 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NID2Q14112 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NID2Q14112 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NID2Q14112 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NID2Q14112 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NID2Q14112 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NID2Q14112 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NID2Q14112 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NID2Q14112 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NID2Q14112 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NID2Q14112 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NID2Q14112 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NID2Q14112 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NID2Q14112 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NID2Q14112 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NID2Q14112 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NID2Q14112 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NID2Q14112 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NID2Q14112 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NID2Q14112 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NID2Q14112 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NID2Q14112 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NID2Q14112 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NID2Q14112 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NID2Q14112 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NID2Q14112 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NID2Q14112 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NID2Q14112 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NID2Q14112 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NID2Q14112 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NID2Q14112 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NID2Q14112 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NID2Q14112 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NID2Q14112 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NID2Q14112 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NID2Q14112 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NID2Q14112 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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