Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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FAM3AP98173 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FAM3AP98173 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FAM3AP98173 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FAM3AP98173 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FAM3AP98173 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FAM3AP98173 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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