Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP1P59025 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP1P59025 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP1P59025 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP1P59025 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP1P59025 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP1P59025 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP1P59025 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP1P59025 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTP1P59025 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTP1P59025 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP1P59025 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP1P59025 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP1P59025 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP1P59025 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP1P59025 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP1P59025 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP1P59025 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP1P59025 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP1P59025 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP1P59025 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTP1P59025 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTP1P59025 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTP1P59025 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP1P59025 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP1P59025 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP1P59025 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP1P59025 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP1P59025 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP1P59025 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP1P59025 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP1P59025 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP1P59025 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP1P59025 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP1P59025 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTP1P59025 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP1P59025 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP1P59025 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP1P59025 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP1P59025 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP1P59025 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP1P59025 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP1P59025 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP1P59025 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP1P59025 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP1P59025 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP1P59025 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP1P59025 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTP1P59025 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP1P59025 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP1P59025 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP1P59025 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP1P59025 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP1P59025 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP1P59025 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP1P59025 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP1P59025 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP1P59025 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP1P59025 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP1P59025 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP1P59025 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTP1P59025 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP1P59025 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP1P59025 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP1P59025 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP1P59025 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP1P59025 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP1P59025 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP1P59025 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP1P59025 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms