Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTNP21246 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTNP21246 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTNP21246 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTNP21246 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTNP21246 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTNP21246 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTNP21246 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTNP21246 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTNP21246 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTNP21246 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTNP21246 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTNP21246 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTNP21246 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTNP21246 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTNP21246 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTNP21246 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTNP21246 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTNP21246 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTNP21246 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTNP21246 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTNP21246 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTNP21246 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTNP21246 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTNP21246 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTNP21246 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTNP21246 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTNP21246 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTNP21246 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTNP21246 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTNP21246 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTNP21246 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTNP21246 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTNP21246 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTNP21246 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTNP21246 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTNP21246 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTNP21246 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTNP21246 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms