Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms