Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPO95166 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GABARAPO95166 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms