Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 KRTAP5-AS1-203ENST00000532922 519 ntTSL 415.26■□□□□ 0.039e-14■■■■■ 33.3
DKC1O60832 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.019e-14■■■■■ 33.3
DKC1O60832 MYO18A-207ENST00000530254 6479 ntTSL 1 (best)14.72□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 33.3
DKC1O60832 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 33.3
DKC1O60832 ZNRF1-211ENST00000579084 571 ntTSL 513.93□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 33.3
DKC1O60832 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 33.3
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DKC1O60832 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 33.3
DKC1O60832 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 33.3
DKC1O60832 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 33.3
DKC1O60832 ZNRF1-203ENST00000564320 607 ntTSL 39.61□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 33.3
DKC1O60832 ZNRF1-209ENST00000568511 485 ntTSL 49.35□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 33.3
DKC1O60832 KIAA0907-202ENST00000368320 4499 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-323■■■■■ 33.2
DKC1O60832 KIAA0907-203ENST00000368321 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.491e-323■■■■■ 33.2
DKC1O60832 SAMD4A-207ENST00000555112 2287 ntTSL 1 (best)22.89■■□□□ 1.262e-7■■■■■ 33.2
DKC1O60832 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 33.2
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DKC1O60832 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 32.9
DKC1O60832 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 32.9
DKC1O60832 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 32.9
DKC1O60832 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 32.9
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DKC1O60832 HNF1A-214ENST00000560968 3030 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 32.9
DKC1O60832 HNF1A-207ENST00000540108 3039 ntTSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 32.9
DKC1O60832 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 32.9
DKC1O60832 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 32.9
DKC1O60832 FARP1-215ENST00000595817 778 ntTSL 512.28□□□□□ -0.448e-20■■■■■ 32.9
DKC1O60832 FARP1-213ENST00000595380 616 ntTSL 511.99□□□□□ -0.498e-20■■■■■ 32.9
DKC1O60832 FARP1-240ENST00000602263 867 ntTSL 511.74□□□□□ -0.538e-20■■■■■ 32.9
DKC1O60832 FARP1-226ENST00000599040 555 ntTSL 510.37□□□□□ -0.758e-20■■■■■ 32.9
DKC1O60832 FARP1-228ENST00000600032 810 ntTSL 510.35□□□□□ -0.758e-20■■■■■ 32.9
DKC1O60832 FARP1-220ENST00000596613 856 ntTSL 59.29□□□□□ -0.928e-20■■■■■ 32.9
DKC1O60832 FARP1-217ENST00000596467 799 ntTSL 59.19□□□□□ -0.948e-20■■■■■ 32.9
DKC1O60832 SIN3B-208ENST00000596638 1104 ntTSL 59.05□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 32.9
DKC1O60832 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.24e-11■■■■■ 32.9
DKC1O60832 MAST2-202ENST00000372008 2528 ntTSL 512.58□□□□□ -0.44e-11■■■■■ 32.9
DKC1O60832 MAST2-207ENST00000482881 858 ntTSL 39.87□□□□□ -0.834e-11■■■■■ 32.9
DKC1O60832 PRKAR1B-207ENST00000430040 1006 ntTSL 319.17■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 32.8
DKC1O60832 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 32.8
DKC1O60832 C11orf24-205ENST00000530166 941 ntTSL 319.48■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 32.8
DKC1O60832 C11orf24-202ENST00000527280 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.48■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 32.8
DKC1O60832 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 32.8
DKC1O60832 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.64e-6■■■■■ 32.8
DKC1O60832 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.115e-6■■■■■ 32.7
DKC1O60832 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.175e-6■■■■■ 32.7
DKC1O60832 CNOT1-212ENST00000567285 722 ntTSL 46.76□□□□□ -1.331e-323■■■■■ 32.6
DKC1O60832 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.32□□□□□ -1.881e-323■■■■■ 32.6
DKC1O60832 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31e-6■■■■■ 32.5
DKC1O60832 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 32.5
DKC1O60832 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.281e-6■■■■■ 32.5
DKC1O60832 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 32.5
DKC1O60832 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 319.04■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 32.5
DKC1O60832 MAD1L1-208ENST00000437877 864 ntTSL 217.13■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 32.5
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DKC1O60832 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.47□□□□□ -1.371e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.214e-48■■■■■ 32.4
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DKC1O60832 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 310.67□□□□□ -0.74e-48■■■■■ 32.4
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DKC1O60832 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.984e-48■■■■■ 32.4
DKC1O60832 LINC00963-205ENST00000444184 1887 ntTSL 1 (best)21.25■□□□□ 0.991e-14■■■■■ 32.4
DKC1O60832 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.571e-14■■■■■ 32.4
DKC1O60832 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.161e-14■■■■■ 32.4
DKC1O60832 LINC00963-210ENST00000608272 612 ntTSL 514.52□□□□□ -0.091e-14■■■■■ 32.4
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DKC1O60832 LINC00963-220ENST00000625171 830 ntTSL 513.15□□□□□ -0.31e-14■■■■■ 32.4
DKC1O60832 LINC00963-211ENST00000608369 961 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.411e-14■■■■■ 32.4
DKC1O60832 LINC00963-214ENST00000622680 781 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.461e-14■■■■■ 32.4
DKC1O60832 LINC00963-207ENST00000454635 910 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.491e-14■■■■■ 32.4
DKC1O60832 LINC00963-202ENST00000419300 9557 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-14■■■■■ 32.4
DKC1O60832 LINC00963-206ENST00000453213 469 ntTSL 39.43□□□□□ -0.91e-14■■■■■ 32.4
DKC1O60832 LINC00963-219ENST00000624390 472 ntTSL 59.39□□□□□ -0.911e-14■■■■■ 32.4
DKC1O60832 LINC00963-209ENST00000607931 473 ntTSL 59.35□□□□□ -0.911e-14■■■■■ 32.4
DKC1O60832 LINC00963-218ENST00000624138 261 ntTSL 58.04□□□□□ -1.121e-14■■■■■ 32.4
DKC1O60832 LINC00963-215ENST00000622972 444 ntTSL 56.52□□□□□ -1.371e-14■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-217ENST00000492572 1656 ntTSL 519.17■□□□□ 0.661e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-208ENST00000449494 622 ntTSL 516.77■□□□□ 0.281e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.041e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-210ENST00000458500 585 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.021e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.031e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-215ENST00000489200 1519 ntTSL 213.97□□□□□ -0.171e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.231e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-214ENST00000485196 839 ntTSL 213.27□□□□□ -0.291e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-207ENST00000436473 657 ntTSL 213.2□□□□□ -0.31e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.361e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-213ENST00000482732 1731 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.431e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-216ENST00000491035 1369 ntTSL 512.12□□□□□ -0.471e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-211ENST00000467168 802 ntTSL 211.84□□□□□ -0.511e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-209ENST00000451365 713 ntTSL 1 (best)11.8□□□□□ -0.521e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-201ENST00000344746 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)11.4□□□□□ -0.581e-323■■■■■ 32.4
DKC1O60832 RPL10-205ENST00000427682 457 ntTSL 511.38□□□□□ -0.591e-323■■■■■ 32.4
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