Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRNDQ9UKY0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRNDQ9UKY0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms