Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms