Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HACE1Q8IYU2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HACE1Q8IYU2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HACE1Q8IYU2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms