Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT25

CDC42BPA, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPAQ5VT25 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPAQ5VT25 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPAQ5VT25 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPAQ5VT25 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC42BPAQ5VT25 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC42BPAQ5VT25 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC42BPAQ5VT25 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC42BPAQ5VT25 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC42BPAQ5VT25 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPAQ5VT25 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.89■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CDC42BPAQ5VT25 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms