Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBAP2Q5T6F2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBAP2Q5T6F2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP2Q5T6F2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms