Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB1P08034 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB1P08034 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB1P08034 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB1P08034 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB1P08034 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB1P08034 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB1P08034 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB1P08034 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB1P08034 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB1P08034 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB1P08034 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB1P08034 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB1P08034 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB1P08034 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB1P08034 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB1P08034 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB1P08034 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB1P08034 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJB1P08034 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJB1P08034 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJB1P08034 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJB1P08034 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJB1P08034 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB1P08034 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB1P08034 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB1P08034 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB1P08034 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB1P08034 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB1P08034 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB1P08034 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB1P08034 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB1P08034 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB1P08034 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB1P08034 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB1P08034 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB1P08034 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB1P08034 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB1P08034 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB1P08034 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB1P08034 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB1P08034 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB1P08034 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB1P08034 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB1P08034 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB1P08034 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB1P08034 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB1P08034 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB1P08034 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB1P08034 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB1P08034 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB1P08034 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB1P08034 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB1P08034 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB1P08034 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB1P08034 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB1P08034 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB1P08034 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB1P08034 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB1P08034 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB1P08034 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB1P08034 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB1P08034 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB1P08034 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB1P08034 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB1P08034 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB1P08034 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB1P08034 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB1P08034 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB1P08034 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms