Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAD1O00515 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LAD1O00515 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAD1O00515 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAD1O00515 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAD1O00515 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAD1O00515 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LAD1O00515 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LAD1O00515 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAD1O00515 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAD1O00515 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAD1O00515 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAD1O00515 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAD1O00515 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAD1O00515 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAD1O00515 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAD1O00515 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAD1O00515 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAD1O00515 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAD1O00515 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAD1O00515 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAD1O00515 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAD1O00515 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAD1O00515 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LAD1O00515 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAD1O00515 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAD1O00515 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAD1O00515 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAD1O00515 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAD1O00515 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAD1O00515 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAD1O00515 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAD1O00515 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAD1O00515 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAD1O00515 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAD1O00515 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAD1O00515 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LAD1O00515 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAD1O00515 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAD1O00515 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LAD1O00515 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAD1O00515 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAD1O00515 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAD1O00515 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAD1O00515 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAD1O00515 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAD1O00515 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAD1O00515 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAD1O00515 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAD1O00515 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAD1O00515 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAD1O00515 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAD1O00515 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAD1O00515 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LAD1O00515 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAD1O00515 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LAD1O00515 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAD1O00515 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAD1O00515 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAD1O00515 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAD1O00515 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAD1O00515 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAD1O00515 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAD1O00515 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAD1O00515 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAD1O00515 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAD1O00515 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAD1O00515 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAD1O00515 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAD1O00515 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAD1O00515 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAD1O00515 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAD1O00515 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAD1O00515 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAD1O00515 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAD1O00515 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAD1O00515 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAD1O00515 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAD1O00515 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAD1O00515 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAD1O00515 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAD1O00515 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAD1O00515 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LAD1O00515 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms