Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN11AQ9UI33 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN11AQ9UI33 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms