Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC4BQ9NT99 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms