Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPS4Q9NQG7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms