Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TIMM29Q9BSF4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMM29Q9BSF4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms