Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR10

SPATA25, Spermatogenesis-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA25Q9BR10 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPATA25Q9BR10 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA25Q9BR10 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms