Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNE4Q8N205 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SYNE4Q8N205 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNE4Q8N205 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms