Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC11Q7Z392 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms