Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN17

LIN28B, Protein lin-28 homolog B, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28BQ6ZN17 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 35
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LIN28BQ6ZN17 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.363e-8■■■■■ 34.8
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LIN28BQ6ZN17 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.13e-7■■■■■ 34.7
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LIN28BQ6ZN17 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.235e-10■■■■■ 34.7
LIN28BQ6ZN17 TBP-205ENST00000446829 892 ntTSL 513.63□□□□□ -0.235e-10■■■■■ 34.7
LIN28BQ6ZN17 TBP-201ENST00000230354 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.385e-10■■■■■ 34.7
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LIN28BQ6ZN17 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.087e-12■■■■■ 34.7
LIN28BQ6ZN17 EEF1G-203ENST00000525340 2496 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.294e-17■■■■■ 34.7
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LIN28BQ6ZN17 SMC4-203ENST00000462668 4235 ntTSL 22.49□□□□□ -2.011e-8■■■■■ 34.6
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