Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WASHC2DQ5SRD0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms