Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDRF1Q3B7T1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms