Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME3Q16798 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME3Q16798 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME3Q16798 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME3Q16798 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME3Q16798 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME3Q16798 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME3Q16798 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME3Q16798 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ME3Q16798 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME3Q16798 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME3Q16798 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME3Q16798 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ME3Q16798 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ME3Q16798 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ME3Q16798 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME3Q16798 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME3Q16798 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME3Q16798 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME3Q16798 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME3Q16798 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME3Q16798 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ME3Q16798 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME3Q16798 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ME3Q16798 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME3Q16798 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ME3Q16798 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME3Q16798 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ME3Q16798 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ME3Q16798 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME3Q16798 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME3Q16798 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME3Q16798 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME3Q16798 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ME3Q16798 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ME3Q16798 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME3Q16798 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME3Q16798 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME3Q16798 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME3Q16798 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME3Q16798 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME3Q16798 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME3Q16798 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME3Q16798 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME3Q16798 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME3Q16798 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME3Q16798 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ME3Q16798 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME3Q16798 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME3Q16798 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME3Q16798 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME3Q16798 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME3Q16798 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME3Q16798 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME3Q16798 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME3Q16798 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME3Q16798 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME3Q16798 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME3Q16798 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ME3Q16798 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ME3Q16798 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ME3Q16798 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ME3Q16798 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ME3Q16798 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ME3Q16798 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ME3Q16798 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ME3Q16798 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ME3Q16798 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ME3Q16798 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ME3Q16798 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ME3Q16798 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME3Q16798 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME3Q16798 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME3Q16798 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME3Q16798 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME3Q16798 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME3Q16798 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME3Q16798 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ME3Q16798 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ME3Q16798 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME3Q16798 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ME3Q16798 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME3Q16798 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME3Q16798 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ME3Q16798 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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