Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIGQ13278 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIGQ13278 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIGQ13278 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIGQ13278 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIGQ13278 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIGQ13278 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIGQ13278 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIGQ13278 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RIGQ13278 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RIGQ13278 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIGQ13278 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RIGQ13278 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIGQ13278 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIGQ13278 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIGQ13278 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIGQ13278 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIGQ13278 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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