Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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NPRL3Q12980 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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NPRL3Q12980 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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NPRL3Q12980 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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NPRL3Q12980 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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NPRL3Q12980 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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NPRL3Q12980 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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NPRL3Q12980 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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NPRL3Q12980 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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NPRL3Q12980 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPRL3Q12980 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPRL3Q12980 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPRL3Q12980 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPRL3Q12980 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPRL3Q12980 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPRL3Q12980 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPRL3Q12980 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPRL3Q12980 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPRL3Q12980 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPRL3Q12980 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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