Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX5P78411 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX5P78411 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX5P78411 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX5P78411 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX5P78411 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX5P78411 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX5P78411 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX5P78411 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX5P78411 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX5P78411 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX5P78411 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX5P78411 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX5P78411 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX5P78411 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX5P78411 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX5P78411 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX5P78411 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX5P78411 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX5P78411 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX5P78411 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX5P78411 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX5P78411 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX5P78411 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX5P78411 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX5P78411 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX5P78411 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX5P78411 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX5P78411 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX5P78411 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX5P78411 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX5P78411 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX5P78411 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX5P78411 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX5P78411 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX5P78411 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX5P78411 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX5P78411 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX5P78411 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX5P78411 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX5P78411 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX5P78411 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX5P78411 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX5P78411 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX5P78411 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX5P78411 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX5P78411 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX5P78411 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX5P78411 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX5P78411 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX5P78411 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX5P78411 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX5P78411 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX5P78411 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX5P78411 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX5P78411 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX5P78411 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX5P78411 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX5P78411 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX5P78411 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX5P78411 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX5P78411 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX5P78411 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX5P78411 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX5P78411 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX5P78411 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX5P78411 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX5P78411 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX5P78411 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX5P78411 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX5P78411 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX5P78411 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX5P78411 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX5P78411 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX5P78411 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX5P78411 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX5P78411 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX5P78411 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX5P78411 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX5P78411 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX5P78411 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX5P78411 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX5P78411 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX5P78411 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX5P78411 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX5P78411 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX5P78411 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX5P78411 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX5P78411 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX5P78411 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX5P78411 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX5P78411 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX5P78411 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX5P78411 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX5P78411 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX5P78411 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX5P78411 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX5P78411 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX5P78411 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX5P78411 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms