Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN1P53805 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN1P53805 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN1P53805 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCAN1P53805 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCAN1P53805 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCAN1P53805 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms