Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP5P51878 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP5P51878 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP5P51878 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP5P51878 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP5P51878 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP5P51878 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP5P51878 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP5P51878 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP5P51878 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP5P51878 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP5P51878 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP5P51878 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP5P51878 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP5P51878 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP5P51878 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP5P51878 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP5P51878 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP5P51878 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP5P51878 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP5P51878 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP5P51878 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP5P51878 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP5P51878 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP5P51878 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP5P51878 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP5P51878 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP5P51878 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP5P51878 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP5P51878 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP5P51878 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP5P51878 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP5P51878 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP5P51878 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP5P51878 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP5P51878 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP5P51878 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP5P51878 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP5P51878 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP5P51878 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP5P51878 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP5P51878 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP5P51878 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP5P51878 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP5P51878 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP5P51878 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP5P51878 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP5P51878 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP5P51878 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP5P51878 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP5P51878 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP5P51878 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP5P51878 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP5P51878 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP5P51878 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP5P51878 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP5P51878 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP5P51878 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP5P51878 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP5P51878 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP5P51878 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP5P51878 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP5P51878 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP5P51878 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP5P51878 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP5P51878 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP5P51878 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP5P51878 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP5P51878 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP5P51878 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP5P51878 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP5P51878 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP5P51878 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP5P51878 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP5P51878 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP5P51878 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP5P51878 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP5P51878 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP5P51878 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP5P51878 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP5P51878 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP5P51878 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP5P51878 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP5P51878 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP5P51878 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP5P51878 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms