Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD8P48556 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMD8P48556 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms