Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA4P43358 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MAGEA4P43358 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA4P43358 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA4P43358 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA4P43358 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA4P43358 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA4P43358 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA4P43358 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA4P43358 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA4P43358 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA4P43358 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA4P43358 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA4P43358 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA4P43358 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEA4P43358 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms