Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2BP42772 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2BP42772 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2BP42772 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2BP42772 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2BP42772 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2BP42772 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2BP42772 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2BP42772 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2BP42772 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2BP42772 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms