Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms