Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CA4P22748 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CA4P22748 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CA4P22748 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CA4P22748 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA4P22748 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA4P22748 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA4P22748 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA4P22748 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA4P22748 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CA4P22748 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CA4P22748 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA4P22748 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA4P22748 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA4P22748 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA4P22748 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA4P22748 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA4P22748 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA4P22748 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA4P22748 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA4P22748 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA4P22748 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA4P22748 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA4P22748 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA4P22748 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA4P22748 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA4P22748 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms