Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1P21675 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1P21675 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1P21675 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1P21675 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TAF1P21675 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1P21675 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1P21675 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1P21675 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1P21675 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1P21675 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1P21675 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1P21675 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1P21675 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TAF1P21675 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1P21675 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1P21675 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1P21675 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1P21675 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1P21675 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1P21675 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1P21675 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1P21675 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1P21675 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1P21675 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1P21675 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1P21675 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1P21675 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1P21675 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1P21675 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1P21675 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1P21675 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1P21675 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1P21675 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1P21675 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1P21675 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1P21675 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1P21675 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1P21675 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1P21675 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1P21675 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1P21675 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1P21675 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1P21675 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1P21675 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1P21675 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1P21675 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1P21675 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1P21675 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1P21675 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1P21675 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1P21675 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1P21675 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1P21675 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1P21675 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1P21675 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1P21675 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1P21675 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1P21675 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1P21675 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1P21675 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1P21675 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1P21675 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1P21675 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1P21675 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1P21675 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1P21675 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1P21675 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1P21675 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1P21675 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1P21675 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1P21675 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1P21675 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1P21675 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1P21675 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TAF1P21675 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TAF1P21675 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF1P21675 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF1P21675 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF1P21675 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF1P21675 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1P21675 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1P21675 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1P21675 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1P21675 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1P21675 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1P21675 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1P21675 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1P21675 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1P21675 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1P21675 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1P21675 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1P21675 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1P21675 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1P21675 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1P21675 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1P21675 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1P21675 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1P21675 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1P21675 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms