Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTNP21246 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTNP21246 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTNP21246 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTNP21246 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTNP21246 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTNP21246 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTNP21246 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTNP21246 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTNP21246 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTNP21246 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTNP21246 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTNP21246 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTNP21246 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTNP21246 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTNP21246 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTNP21246 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTNP21246 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTNP21246 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTNP21246 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTNP21246 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTNP21246 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTNP21246 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTNP21246 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTNP21246 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTNP21246 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTNP21246 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTNP21246 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTNP21246 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTNP21246 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTNP21246 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTNP21246 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTNP21246 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTNP21246 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTNP21246 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTNP21246 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTNP21246 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTNP21246 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTNP21246 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTNP21246 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTNP21246 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTNP21246 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTNP21246 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms