Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFLP07196 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFLP07196 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFLP07196 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFLP07196 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFLP07196 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFLP07196 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFLP07196 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFLP07196 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFLP07196 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFLP07196 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFLP07196 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFLP07196 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFLP07196 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFLP07196 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFLP07196 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFLP07196 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEFLP07196 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEFLP07196 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEFLP07196 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEFLP07196 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEFLP07196 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEFLP07196 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFLP07196 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFLP07196 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFLP07196 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFLP07196 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFLP07196 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFLP07196 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFLP07196 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFLP07196 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFLP07196 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFLP07196 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFLP07196 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFLP07196 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFLP07196 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFLP07196 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFLP07196 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFLP07196 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFLP07196 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFLP07196 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFLP07196 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFLP07196 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFLP07196 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFLP07196 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFLP07196 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFLP07196 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFLP07196 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFLP07196 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFLP07196 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFLP07196 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFLP07196 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFLP07196 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFLP07196 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFLP07196 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFLP07196 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFLP07196 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFLP07196 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFLP07196 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFLP07196 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFLP07196 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFLP07196 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFLP07196 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFLP07196 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFLP07196 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFLP07196 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFLP07196 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFLP07196 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFLP07196 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFLP07196 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFLP07196 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFLP07196 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFLP07196 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEFLP07196 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEFLP07196 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEFLP07196 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEFLP07196 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEFLP07196 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEFLP07196 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEFLP07196 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEFLP07196 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEFLP07196 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFLP07196 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFLP07196 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms