Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCOR1Q9UKL0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCOR1Q9UKL0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RCOR1Q9UKL0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR1Q9UKL0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR1Q9UKL0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR1Q9UKL0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR1Q9UKL0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR1Q9UKL0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR1Q9UKL0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR1Q9UKL0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR1Q9UKL0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR1Q9UKL0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR1Q9UKL0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR1Q9UKL0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCOR1Q9UKL0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms