Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC4BQ9NT99 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC4BQ9NT99 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC4BQ9NT99 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms