Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX0

PRDM6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM6Q9NQX0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM6Q9NQX0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM6Q9NQX0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms